La Auditoría es un medio que permite a los miembros de una organización y a sus partes interesadas, verificar el grado de cumplimiento con los requisitos de las normas validadas por GFSI (FSSC 22000, BRC, IFS) para un Sistema de Gestión de Inocuidad Alimentaria, así como los procedimientos internos definidos por la empresa. Junto a ello, identificar oportunidades de mejora para prevenir situaciones no deseadas, y realizar de manera efectiva las actividades de seguimiento a las acciones correctivas que resulten del proceso de Auditoría Interna o Externa.

En el caso de las auditorias de Certificación o llamadas auditorias de tercera parte, el proceso de auditoría viene a validar y constatar, a través de evidencias objetivas, que la empresa está en cumplimiento con los requisitos de los estándares de GFSI, con lo cual la empresa puede demostrar su capacidad para proporcionar productos inocuos, que cumplen con los estándares legales aplicables y sus partes interesadas.